Martinská biobanka pre nádorové a zriedkavé ochorenia uchováva tisíce biologických vzoriek, ktoré slúžia na výskum, presnejšiu diagnostiku a vývoj účinnejších liečebných postupov. Ako informovala televízia STVR vo svojej reportáži, zariadenie vstupuje do ďalšej fázy rozvoja a čaká ho významná investícia do modernizácie informačných systémov.

Biobanka disponuje špičkovou technológiou na dlhodobé skladovanie krvi, buniek a tkanív. V troch depozitároch dokáže uchovať až sedem miliónov vzoriek. Podľa riaditeľky, Zuzany Dankovej, je aktuálne prioritou intenzívne rozšíriť zbierky tak, aby boli pre vedcov ešte hodnotnejšie. „Teraz sa musíme na niekoľko rokov zameriavať na intenzívne zbieranie vzoriek tak, aby tie kolekcie, ktoré máme, boli zaujímavé pre vedu a výskum a aby tam bol aj dostatočný počet vzoriek v danej kolekcii,“ uviedla Danková pre STVR.

Ilustračné foto. Zdroj: biobankslovakia.jlfuk.sk

Takmer dvojmiliónová investícia do digitalizácie

Súčasťou projektu je aj rozsiahle dátové úložisko digitalizovaných vzoriek. Práve digitálna biobanka má dostať investíciu vo výške takmer dvoch miliónov eur. Podľa dekanky Jesseniovej lekárskej fakulty UK v Martine, Andrey Čalkovskej, je moderný informačný systém nevyhnutný na to, aby biobanka dokázala plnohodnotne spracovávať a uchovávať vzorky.

IT špecialista biobanky, Marián Mižik, v reportáži STVR doplnil, že nový systém bude pripravený na dlhodobú štandardizáciu dát, čo je kľúčové pre medzinárodnú spoluprácu.

Kvalita vzoriek rozhoduje o kvalite výskumu

Biobanky monitorujú vzorky už od momentu odberu – sledujú čas, teplotu aj spôsob transportu. Tieto údaje sú podľa odborníkov čoraz dôležitejšie, najmä ak sa vzorky kombinujú z rôznych krajín.

Riaditeľka biobanky je toho názoru, že dáta o kvalite odberu sú pre vedcov zásadné. „Ak si potrebujú spájať vzorky z rôznych biobánk, tak aby to boli navzájom kompatibilné súbory, aby mali aj všetky tieto dôležité informácie, ktoré hovoria o kvalite. To znamená, že v podstate potom aj výsledky výskumu sú ako keby hodnovernejšie, lebo sa odstránia všetky, nazýva sa to, preanalytické chyby,“ vysvetlila pre STVR Danková.

Ilustračné foto. Zdroj: biobankslovakia.jlfuk.sk

Slovensko je súčasťou najväčšej európskej siete biobánk

Martinská biobanka je od minulého roka zapojená do najväčšej európskej siete biobánk, čo slovenským vedcom otvára nové možnosti spolupráce a prístupu k vzácnym vzorkám. „Uľahčuje prístup ku vysoko kvalitným vzorkám a prislúchajúcim dátam pre všetkých vedcov a výskumníkov. Takisto nám to otvára nový priestor participovať v excelentných európskych projektoch,“ potvrdila v reportáži riaditeľka biobanky.

Mižik dodal, že európske biobanky poskytujú anonymizované data sety, vďaka ktorým môžu výskumníci presne zistiť, kde sa konkrétne vzorky nachádzajú a či sú pre ich projekty vhodné.

Cieľom je prepojenie so zahraničím

Martinská biobanka je zároveň koordinátorom národnej siete biobánk. Tento rok plánuje prepojiť slovenské informačné systémy so zahraničnými partnermi, čo umožní jednoduchšie vyhľadávanie vzoriek v rámci Európy. „My ich samozrejme budeme zdieľať v nejakej anonymizovanej forme s odstránením všetkých primárnych identifikátorov,“ uzavrel IT špecialista biobanky.